济宁医学院基础医学实验教学中心坐落于风景秀丽的太白湖之滨。中心包括人体解剖学实验室、形态学实验室、生化与分子生物学实验室、机能学实验室。2007年，基础医学院实验教学中心被批准为省级实验教学中心。经过多年的建设，现教学中心实验用房使用面积达5510m2，设备数达3540台（套），设备总值3600万元，品质精良，规模宏大，居国内外先进水平。目前，中心已经实现WIFI全覆盖，建立了完备的网络信息管理平台，多方位实施开放式和互动式医学实验教学。